Ciao Mary,
il consiglio è innanzi tutto di verificare quando sarà l'inizio effettivo del master perché solo così potrai fare delle valutazioni più concrete. Se poi dovesse succedere quello che temi, e cioè che le date del contratto e del master coincidono, e dal momento che il lavoro non ti entusiasma e non sembrerebbe che tu sia più di tanto interessata a un eventuale inserimento in azienda, la cosa migliore da fare sarebbe quella di comunicare la decisione di interrompere il percorso motivandola con la volontà di iscriverti al master. Non c'è nulla di male: lo stage serve per farsi un'idea di un impiego e iniziare a formarsi, ma senza impegni per nessuna delle due parti. E se lo stagista decide di andarsene prima, è legittimato a farlo (sempre che, caso assai raro, non sia prevista qualche limitazione nella convenzione firmata).

E non dovresti farti troppi problemi neppure a chiedere lumi sul tuo pagamento di quei due mesi, perché la retribuzione è parte integrante del lavoro. E poi dovresti a nostro parere porti anche una domanda: davvero non mi interessa questo lavoro e non ne ho bisogno? Decidere insomma se cogliere o meno l'opportunità che ti si sta presentando o se invece preferisci e sei sicura di voler proseguire con il master.
Facci sapere cosa deciderai, e un caro saluto